Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHRNA6Q15825 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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