Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SIX1Q15475 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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