Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
RFTN1Q14699 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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