Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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ITGA9Q13797 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
ITGA9Q13797 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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