Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms