Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTCH1Q13635 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PTCH1Q13635 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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