Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ABCA12-203ENST00000412081 485 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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FOXE3Q13461 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXE3Q13461 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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