Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
TCOF1Q13428 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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TCOF1Q13428 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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TCOF1Q13428 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TCOF1Q13428 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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