Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms