Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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FOXF2Q12947 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXF2Q12947 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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