Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
KIF5AQ12840 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms