Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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