Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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HOXD10P28358 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
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HOXD10P28358 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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HOXD10P28358 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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HOXD10P28358 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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