Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZNF271P-201ENST00000399070 5124 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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HOXA2O43364 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXA2O43364 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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