Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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USP18Q9UMW8 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP18Q9UMW8 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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USP18Q9UMW8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP18Q9UMW8 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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