Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms