Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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