Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117 ms