Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
NFIXQ14938 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms