Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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CHD4Q14839 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHD4Q14839 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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CHD4Q14839 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHD4Q14839 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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