Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMCO1Q147U7 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
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