Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RFTN1Q14699 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms