Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GTF2H3Q13889 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms