Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
NEUROD1Q13562 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms