Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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