Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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EFEMP1Q12805 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 FLRT3-201ENST00000341420 3971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EFEMP1Q12805 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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