Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
APOBRQ0VD83 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms