Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F1Q01094 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F1Q01094 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms