Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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PGGT1BP53609 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PGGT1BP53609 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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