Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ERVV-1B6SEH8 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ERVV-1B6SEH8 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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