Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SH3BP1Q9Y3L3 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms