Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COPS7AQ9UBW8 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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COPS7AQ9UBW8 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
COPS7AQ9UBW8 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COPS7AQ9UBW8 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COPS7AQ9UBW8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
COPS7AQ9UBW8 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COPS7AQ9UBW8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COPS7AQ9UBW8 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
COPS7AQ9UBW8 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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