Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
TM6SF1Q9BZW5 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms