Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CCDC142Q17RM4 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms