Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
FSCN1Q16658 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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