Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PDK4Q16654 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.6 ms