Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PTPRRQ15256 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRRQ15256 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms