Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms