Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CDH18Q13634 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CDH18Q13634 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CDH18Q13634 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
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CDH18Q13634 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDH18Q13634 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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