Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CUL1Q13616 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CUL1Q13616 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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