Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
TCOF1Q13428 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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