Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SP140Q13342 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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