Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RXRBP28702 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RXRBP28702 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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RXRBP28702 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RXRBP28702 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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