Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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UBXN4Q92575 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
UBXN4Q92575 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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