Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CTXN3Q4LDR2 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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