Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms