Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SYCP1Q15431 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYCP1Q15431 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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