Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMCO1Q147U7 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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