Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CBFBQ13951 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms