Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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ITGA9Q13797 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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ITGA9Q13797 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ITGA9Q13797 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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